#62 Steady states of metabolic networks and Dingo with Apostolos Chalkis

the bioinformatics chat

เนื้อหาจัดทำโดย Roman Cheplyaka เนื้อหาพอดแคสต์ทั้งหมด รวมถึงตอน กราฟิก และคำอธิบายพอดแคสต์ได้รับการอัปโหลดและจัดเตรียมโดย Roman Cheplyaka หรือพันธมิตรแพลตฟอร์มพอดแคสต์โดยตรง หากคุณเชื่อว่ามีบุคคลอื่นใช้งานที่มีลิขสิทธิ์ของคุณโดยไม่ได้รับอนุญาต คุณสามารถปฏิบัติตามขั้นตอนที่อธิบายไว้ที่นี่ https://th.player.fm/legal

2+ y ago 38:25

MP3•หน้าโฮมของตอน

In this episode, Apostolos Chalkis presents sampling steady states of metabolic networks as an alternative to the widely used flux balance analysis (FBA). We also discuss dingo, a Python package written by Apostolos that employs geometric random walks to sample steady states. You can see dingo in action here.

Links:

Dingo on GitHub
Searching for COVID-19 treatments using metabolic networks
Tweag open source fellowships
This episode was originally published on the Compositional podcast.

If you enjoyed this episode, please consider supporting the podcast on Patreon.

70 ตอน